बागेश्वर नगर सदा नीरा सरयू व गोमती नदियों के संगम पर बसा है और इस नगर की बसासट दोनों ही नदियों के किनारे है। अब समय के साथ सरयू व गोमती नदियों में दिनोंदिन प्रदूषण बढ़ता जा रहा है।

नगर में जगह-जगह गंदे नाले इन नदियों में छोड़े जा रहे हैं, जो लगातार इन नदियों को प्रदूषित कर रहे हैं। इन्हीं नदियों से नगर की पेयजल व्यवस्था भी चलती है और इन नदियों की स्वच्छता व निर्मलता बनाए रखने के लिए लंबे समय से लोग सीवर लाइन की मांग कर रहे हैं, जो अभी तक स्वीकृत नही हो पाई है।

नदियों के प्रदूषण को गंभीर विषय मानते हुए नगर पालिका के अधिकारी का भी कहना है कि इसके लिए सीवर लाइन का प्रस्ताव शासन को भेजा गया है। पेयजल निगम की ओर से इसके निर्माण के लिए 39 करोड का आंकलन भी तैयार किया गया है, लेकिन अभी तक शासन से स्वीकृति नहीं हो पाई है।